Subnautica - это "сюрвайвалкрафт", в котором игроков ждет путешествие на далекую загадочную планету, почти целиком покрытую толщей воды. Волей случая исследовательский корабль с протагонистом на борту терпит крушение на этой планете, и все, что главному герою остается - это выжить в крайне экстремальных условиях, а также сделать все возможное, чтобы добраться до дома.

Для этого игроки будут вынуждены искать полезные ископаемые, осваивать огромную карту, разбитую на множество разных биомов, и пытаться разгадать тайну древних сооружений пришельцев. С каждым шагом игроки будут погружаться все глубже и глубже, оказываясь в различных уголках океана, столь же прекрасного, сколь и смертоносного.