Скуби и Шэгги нюхают еду, которая ведет их в жуткое болото. Они встречают жительницу Лизу, которая просит их помочь найти ингредиенты для ее тушеного мяса. Тем временем им предстоит разгадать две загадки с бандой Mystery Inc., тайно собирая ингредиенты. В этом трехмерном платформере вы можете управлять 5 членами банды, каждый из которых имеет разные навыки и функции. Друг также может одновременно играть в кооперативном режиме. Вы можете бегать, прыгать, сражаться с врагами и решать головоломки. Следите за своей шкалой здоровья, которая будет уменьшаться при ударе врага, но будет восстанавливаться со временем или после победы над врагами.

По пути можно найти коллекционные предметы, такие как медальон Скуби на ошейнике, ингредиенты для сэндвича с хаги, фотографии синих призраков, костюмы и буквы для заклинания Скуби. Награды даются за выполнение определенных задач. В клубе Болота вы можете просмотреть свои коллекционные предметы, награды, варианты и чит-коды. Получайте маленькие маски каждый раз, когда вы побеждаете врага, и когда наберете достаточное количество типов, вы получите информацию об этом враге в Clubhouse.

Другие места, вовлеченные в тайны, - это город-призрак на юго-западе под названием Эль-Мунчо, который преследует Эль-Скариячи, и заснеженная горная вершина под названием Воющие пики, где йети отпугивает туристов.